KUDQI dibangunkan pada 2001 selepas mendapat pengiktirafan daripada Universiti Al-Azhar, Mesir dengan tempoh pengajian selama 3 tahun di KUDQI dan satu tahun di Al-Azhar (3+1) untuk mendapat penganugerahan ijazah pertama (Sarjana Muda). Ia telah diasaskan oleh Mantan Ketua Dewan Ulama’ PAS Pusat, Almarhum Tuan Guru Dato’ Harun Taib.